+Marker Data: SOL3101

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_09
Marker Type SNP
Map Position 89.0
Annotation
Source Name YFR04C02C
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd TCGGGGAACTTCGTTGTTGTAGAT
STS_primer_rev ATCTTTGGCAAGGTCATGCTCATT
amplicon_seq NNNNNNNNNNNNCCAGGCATCGATTTCACTGTATGATTTTTTATTATTCTATGCTTAATTGTGCAATTTTTCAGTATCGATTTATGCATTACCTATGAGCTCTTTATGGATCCACTTTTAAATTTGCTTTTAGATGTGCGTTATTTTTTCTCGTGTCTGTTTATGATTTTGCTCTTTGGAATTTTGTATAGATTTTGATAGATAACAATCATAAGAAATGTTGCATGTATAATTCCTCATAGAAATGTTTATACTGATTCTCTTGATGAAATTTCTGTTGACATTTTGTTTATCTACAAATGAATTGCTCTTAAAATTGAGAGAGAGAAATCCTCTTTTTAAAATGTAATTTAAGGTCTAAAACTGAATTCATCTTTTAAGCGGACATCTGAAAGAGAATAGTTTTCTATAAAAGTTAATTTTTAGTATTCAATATGGTAAAATAGCTTATTTCCTCCTTAGTATGATGCTATAAAATCCTTGAGTTGGTCTGAATTGTGTGCTTCAATGACTGGATTTTCCGCTACGTACTGCCAGCAATTGTTTCTTATTCAGAAATTAGTGGCACTTCTGCTGCTCATTATTTGCACTTGTCAACCATCCCACAGTACAAAAAAAAGCCTTTCAACCATTTTAATTTAGACGAAATAGTGAAAAATCAATCAATTAACCATACCTTGATATCAATTTCATTGAGGGTTGTCTATATGATCCCCTATATGGATTTCGCTTCATTGAGGTTGATGTCACTCCAATAATAAACGATTTTCCTTTTNAATGCAAATAGTGAAAAATACTGAGAAGATTGTTTTATGTCCTTAAAGTTTTTATGATTTCCAAATTTCTCCTCTCATAGCTATGTTCTAACCGCCGAATAGCTTGATAGCACCTTTGGCTGACCAATGAGTATTGGAGATATGCCTGATTACANGTCCTAAATTCATCACAGAGCTATCTCGTTTGGTACCAGAGCCAAACAAANTTAAGCTTCAGAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNTCCAGATGCTTCTACGTGACCTTTATTTCATAATGAGAAATCTTATGCAGAAGCTTAAATCCGTGTTTCAAATACCACGGGCTGCCATTCATAACTTCTGAACTATCCTCCAATTGTACAACCCTTNGCATCNTACTACCTGACCTTTTTTCTTCTTCTTTTCTCCTGCACCCATTTCAACATGCATGAATAACCACTAGCCTTCTCTTTGCAAACTCGCATATAAGCCCCATTCCACTCAATCAGCCCTATCACTGAGGTAGTATTGTTAAAGGCTTGCTAAGGCGGACTTAAGCTTGAAGCAAGATGCAAAATACACTATGTGCCTCGTCTCTCTTAGGTGGTGCATCAGCCAACAGTACTAGCACCAAGTCACTAAGCTGTGCACCTCATCTTGATGGGGGGTTGGTCTGGAAGGGCGTGTCAGTAAACGATAAATGTTAATTCTAATTATAATTTTTTTTCATTTCTTATTTAATTTGTTGTAAGTTATATTCTTGAATTACATATTTAATTTTTATCTTTTCCTTAATTTGCGCCTCTGGGTAAAGTAAGAGATGCTCCATCACCAGAAATTTTGGTCTTTGTTTGGTGGTGATGACGAGTCATGGTAATCCAGCACATTCTAATATCAAAAACTTTTTATTAGACAAGAAACAGACTGCTTCCACATCTTTACCATGTCCATTGTCTGCAATTGACATGACTACTAATGGAAGTTTATTTAGTAAAGAAAGATGTAACTTGTTGTTAGTATGTTCTTTGCTTCTGTTCTCTGCAACCTCTTAGTGAAAAAGAAATGGTTAACTTTCTTATCAAGTCTTGTTACTCGCAGGTGACAGGACCTGGAGAAAACGTTGTACACACAATGAAGGGAACATCTGGGAATAAATTTGAGTTTAAGGCCCCTCGTAGTGGGATGTACAAGTTTTGTTTTAAGAATCCTTATTCAACACCAGAAACTGTCTCATCTACATACATAN
SNP_position 274
allele_1 T
allele_2 G
ASP_primer_S GCGGGCTTTATACTGATTCTCTTGATGAAATTT
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCTTTATACTGATTCTCTTGATGAAAGTG
Common_primer TCTCTCAATTTTAAGAGCAATTCATTTGT
enzyme Native Taq
dye SYBR Green I

Line allele-1 allele-2
AE-P03 G G
LS1934 T T
Nakate Shinkuro G G
WCGR112-8 G G

Population Linkage Group Position
AL2010 E_09 89.0
ALF2 AL09 108.5
LW2010 E_09 84.1
LWA2010 LWA_09 88.043
LWAE2012 E_09 72.195
LWF2_2022 E_09 99.2

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain