Typing_Method |
Tm-Shift
|
Marker_Class |
SOL
|
STS_primer_fwd |
CGTTATCGGTAACAGTGAACGACG
|
STS_primer_rev |
TTGTCAAACCCGGTTATAGCCAAC
|
amplicon_seq |
CAGTCGAGTCGTTCTCTATGAACGATACGATTTCTGGAAACTTCGTCGTCGTAGATCATGACATCTTCTGGAGCTCCGATCATCCAGGCATCGATTTCACTGTATGATTTTTTATTATTCTATGCTTAATTGTGCAATTTTTCAGTATCGATTTATGCATTACCTATGAGCTCTTTATGGATCCACTTTTAAATTTGCTTTTAGATGTGCGTTATTTTTTCTCGTGTCTGTTTATGATTTTGCTCTTTGGAATTTTGTATAGATTTTGATAGATAACAATCATAAGAAATGTTGCATGTATAATTCCTCATAGAAATGTTTATACTGATTCTCTTGATGAAATTGCTGTTGACATTTTGTTTATCTACAAATGAATTGCTCTTAAAATTGAGAGAGAGAAATCCTCTTTTTAAAATGTAATTTAAGGTCTAAAACTGAATTCATCTTTTAAGCGGACATCTGAAAGAGAATAGTTTTCTATAAAAGTTAATTTTTAGTATTCAATATGGTAAAATAGCTTATTTCCTCCTTAGTATGATGCTATAAAATCCTTGAGTTGGTCTGAATTGTGTGCTTCAATGACTGGATTTTCCGCTACGTACTGCCAGCAATTGTTTCTTATTCAGAAATTAGTGGCACTTCTGCTGCTCATTATTTGCACTTGTCAACCATCCCACAGTACAAAAAAAAGCCTTTCAACCATTTTAATTTAGACGAAATAGTGAAAAATCAATCAATTAACCATAC
|
SNP_position |
345
|
allele_1 |
G
|
allele_2 |
T
|
ASP_primer_S |
GCGGGCTTTATACTGATTCTCTTGATGAAATTT
|
ASP_primer_L |
GCGGGCAGGGCGGCTTTATACTGATTCTCTTGATGAAATTG
|
Common_primer |
TCTCTCAATTTTAAGAGCAATTCATTTGT
|
enzyme |
Native Taq
|
dye |
SYBR Green I
|