+Marker Data: SOL2095

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_06
Marker Type SNP
Map Position 14.0
Annotation
Source Name SmFL33K21A
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd CCCCACAACAATGCCAAAGATT
STS_primer_rev GTTGTAATGAGGCTGATTGGGAGG
amplicon_seq TGGGGGAAATTTGCAAGGTATTATCTTTCTAATCTCTGTTATTTACCTTTATCCCTCCACCTTTTTTTGCCTTTTATTTAGTGGGGTTGCTGATTTTTGTGTTTGTTTGTTGAAATATATGTTAAAGATTCAATTTTTGGGTCTTTGTTGGGGGAAACTTATAGTCTTTATGATCTCTGTAATGACCTTTGAGCCTTTGATTTACTGGGGTTGCTGTTTCTTGTGGTTTTTGTTCAAATATATGTTAAAGATTCAATTTTTGGGTCTTTTGTTAGGGGAAACTTATAGTCTTTTTGATATTTGTGATTACCTTTTGACCTTTAGTCTAGTGGGGTAGCTGATTTTTTGTGTTTTTTGGTTCAAATATATGTTAAAGATTCAATTTTTTGGTCTTTATTAGTGGGAAGCTTATAGTGTTTGTGATCTCTGTAATTACCTTTGTGCTTTTAATTTACTAGGGGTTGCTGTTTCTTGTGTTTTTTGTTTGTTCAATTATGTTAAAGATTCAATTTTTGGTTTTTATAAGGGGAAACTTATAGTCTCTGTGAATTCTGTAATTACCTTTTTGCCTTTATTTTACTGGGGTTGCTGTTTCTTGTGCCTTCTTTTGTTCAACTAGAAGTGTTAAAGATTCAAATTTTTGGTCTTTACTAGGGGAAACTTATCGTCTTTCTGATCTCTGTAATTACCTTTTTGCCTTTAGTTTACTGGAGTTGCTGTTTCTTGTGTTTTCTTTGCTCAAATATGTGGTAAACATTCAGTTTTTTGGTCTTTTATTAGGGC
SNP_position 134
allele_1 T
allele_2 A
ASP_primer_S GCGGGCTGTTGAAATATATGTTAAAGATTCAAA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCTGTTGAAATATATGTTAAAGATTCAAT
Common_primer TATAAGTTTCCCCCAACAAAGACCCAA
enzyme Stoffel frag.
dye EvaGreen

Line allele-1 allele-2
AE-P03 T T
LS1934 A A
WCGR112-8 T T

Population Linkage Group Position
AL2010 E_06 14.0
LW2010 E_06 7.8
LWA2010 LWA_06 10.811
LWAE2012 E_06 15.75
LWF2_2022 E_06 10.3

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain