Typing_Method |
Tm-Shift
|
Marker_Class |
SOL
|
STS_primer_fwd |
TCTATGATTGGTCACCTGCTTGGA
|
STS_primer_rev |
GCCACCTTAATATCCAGTCGTTCC
|
amplicon_seq |
NAGCTGTGGCACTATTCAGGTGCTTTTATCTCATAATCCCTCAAAGTTTGCTGCAGCTGCAGTTCAATTGCTTTCTAGTTTCTTGTGTAACATTTCATCCAACTATTTTCTTGCATAATTGTAGATTTCCTGGCTGCAGATTCTGATATTTCAGCTTGTGTACCCTGTTGGGTGATTTGGATATTATTTTGGTTTCATATTGTTGAATAGACCAAATCATTCTGTTACTATGTAAGCATCTAATTGAACTAGATAAGGTCATTAGTAAATACACATCTCATACTATTCTTTAGCAGTCTTTTCGAGGGAATTTAAGAAGCAGCAGATTAATTTGGCTTCTTATTTGTTTTGTATGCTCTAGAGCTTGGTTGTGTTTTCTTGAGAGTGAACTTGTGGCTGCAAATACAGAGAGCACAGCTAAAGCTGTTTTACTTAGGAAGCCAGAATTTTTTTACAATTTCGCAACATGAATTGCTTTCCTTCTGAATTTGAGTTCACTTATTGATGTAATATACTGTAAAAAGAAGAGAAAATATTTATGGTGGTTCATATCAGCTGTGAGTGAAAATGCATTATGCCCATTAGTAGCAATGGCACGTTGTGGGACCTAAAGAAGGGGTAGTAAAGGGACTGGGTGACTTTTTACAGAGAGGAAAATTAGTAAAGGCCTAACCAGCTGGTCTTGAAGATATCGAACTGTCGTTCAATGCAAATAAATGACTCATAGGAATATAGAAACATCAACTATCTTGGAATCTGGCTAAACCTTTTTTTTTTNATGACAAGGGAATCCCGCAGCTGCTACCCTTTGGGTGCGGACAGGGTAAAACCCCTGCTCCTATACAATAGCTTGCAANCCACATAAGAGAGGTAACCTACACTAGGCANGTCTGGTGCGACGAGCTCGACCCAAGNGCAANCACCCTGCTTTNGCGCAGGGTNATGANCTGGNNACTCAGCATGNAGTCCAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNTNNNNNNNNCCAAANTAGATGTTGATTGAAGAAGCAAAANGAGATGAACTGCAGCTNATTNCATTTNATCATATGGGTATAGTCGTTTATTTNGGTGACGCGANGTAGATNATGGCGGTTGTTTTAGGATAAGTGATCACNTATTTCAAGATAATTCAAAGATGATTTTCTGCTGCTGCATACTTTCTTGCAGTTTGTTGGGCTGCACAGTATAATGGAAGTTAAATTGAAGGTCTGTTTGTATCTTCTCTGTTCTTGAATTTCATTATAATCTGCCTTGACAGTGGAAAGGATGGTGAAGATACACACTTCTTGGACATTTACTTGAGCATATTGCAGAATCATGTTTTTGCTATACAGTTATAGTTTATTTGTGATAATGATAGATTAATCTTATAGTGCATAGATGTTACAGCATTTATTCTTAAGGCGATTGATGATTACCGATTTCATCCTGTCAATCTTTCTTGACTATACTTTTAATCGTGCCTCTTGCAAAAATTATCTGGCTGAAACTGCTGACTGACAGTTAGAATTGGACTTCTCAGGCAATACGAACTGGTTGGGTTCATCCAAATATTAATCTTGAAAACCCAGATGAAGGCGTGGTAAGGATTTATCTTGTTCATTTAAGCATGGTATATCATCATATGCAAAAAATTTCATTGCATGAAAACTGCTAAGAAAGCTTGTTGTATCAAGAGCATGCAGTTGGTTACACTTGATGGCTTGACTAGCTAGTTAAGTTTAAATTTGCAGCTTCTCTGAATTCGTTACTATATCGCCAAAAGATGGTTTACAGTAAAGTCTTGTATGGAAATGAAAAAGTCACGAGTTATAACTCACAAGTCTATTAGTTTGATTCATATTGTCTGCATTAGTAGGGCTTTTCTCTCACCAAGACAGATTTCTTTTGTGACATGAAAATACAAAGCATTTGATATATCCTATCTCCCCTATTTCACTATTTCAGCTTTTCACCCTTTATTAACTGGTAATCACCACATCTGATGATATGTAATATCAATGAACAGGATACAAATATNNNNNNNNNNNNNNNNN
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SNP_position |
548
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allele_1 |
C
|
allele_2 |
A
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ASP_primer_S |
GCGGGCAAGAAGAGAAAATATTTATGGTGGTTA
|
ASP_primer_L |
GCGGGCAGGGCGGCAAGAAGAGAAAATATTTATGGTGGGTC
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Common_primer |
AATGGGCATAATGCATTTTCACTCACA
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enzyme |
Stoffel frag.
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dye |
EvaGreen
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