+Marker Data: SOL8262

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_04
Marker Type indel
Map Position 53.5
Annotation
Source Name RBW02M12F
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method indel
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd atccgatgagtttcgccctttc
STS_primer_rev cagttgatggcactttctttccgt
amplicon_seq TCTGGTGCTTAATCTATTCTTCTGCTTACTAACGAATGTTCTGATTTGTTTGATATGCATCCGCTTTTTGATTGCTTTCTGTAGTTTGATTTTCATCTAGTTTCTGATTTATGACTTTGACATGAATAGAAATCAAATCTGATGGTTATTTTTGGTAGGAAATTTAATCTGATGGCTCTTAATATCAGTAGACGGCTAATATTTGTTGTAATCATGATGTGGATTGCTAAAAAAGTCAGATTTATATTTTTGGGATTCTGAAAATTATGTTTTCAATTAAGAATTTCTAGATTCCACTGCATTTTTTTGGGAATCTGCTGAGGAGTTTTGTTAGTTGATTAGTTTAGTCATGTTATTGCATATTCATGATTATGGAAGTTGATGTTCCACTGAAGAAAAATTCTGATCTGTTTGCTAGTTGCTACCTATTATGTCGTTGTGTGATGATCTAGGATCTGATAAAGAGTGGAAGAAGGAAAATTACTTTTCTTAAACTATTTTTCCTAGTATGGCATTAGCCAAGCTTAAGACACAGTGCTTGGAGGAATTAGCTTGAGACCACACATTTCTAAATGGGGCATCAAGTTAACATGTTTTTTTTTTTTTTTGnnnnnCAATTACAAACAACTCCCTGTATCAATCACTTTCATTCCTCTCGTTAGAACAGTCTGTAGATCTTCATAAGCTACAGCCCTTACTTGAATTATTTCCTAATTATTGATGTACCTCCACAAGCGGCAAGCCATATTAATTGGTTGACCAACATGAGTGTGATGGTGAGTGTCAGTATATCATTGTAAATTTCTACAGGTTGTCATGTCTTCATGTTTTCAAAATTGTCGTTATGTTTTTCAATATGTTCAGCATGTTTGGGAAAAAAAAAAAGGTGAACTCGGTGACCAAACTGATCAGGTACGCTGATCACCCAGTCTATTTGTTTCGCAGCCACTAGTTCTTTGTTTCCCAGTATGGTACCTGATCATGATGCTTGTATTAGTTTTATTAGCTGGGATGAATATGAATTTAGGACCTTGAGATGTTGTGATATTCTTTAGCCAGTGTAAGGGTAGAGCAGACTCCTTCTACCATTTCTCCTTTACACACACAGAGTTATCTGAATTTCATTATTTCAAATTTTGTCGGCAATATCAGCTTCTTGAATCAGTAGTTTGACAGAATTTACTTTTCCTTGACAGGTACTCACTAACAAAAGCAGTCTGCATTGCTTTTGTGTTGACATTCTTCAGTGCCTTTGATGTGCCTGTATTTTGGCCAATTTTGTTATTCTATTGGTTGGTGCTGTTTGTTTCAACAATGAAGAGGCAAATAATGCACATGGTCAAGTATAAATATGTTCCCTTCACATTTGGCAAGCAGGTAAAATTAAAATTTAGCTTCAATTACATTGGTGTCTTTTCACATCATCCAGGCTGAATTATCTCTGTACTTTTCCCATAATATTTGAAAATGAT
indel__position 472
Indel_primer_fwd GTTTGCTACCTATTATGTCGTTG
Indel_primer_rev AGTGTGGTCTCAAGCTAATTC

Line allele-1 allele-2
AE-P03 INS14 INS14
LS1934 wt wt
Nakate Shinkuro wt wt
WCGR112-8 wt wt

Population Linkage Group Position
AL2010 E_04 53.5
LWA2010 LWA_04 83.725
LWAE2012 E_04 81.539

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain