+Marker Data: CSN051

Crop cucumber
Population CSRILs
Linkage Group 6
Marker Type SSR
Map Position 68.7
Annotation
Source Name 061055C
Source Type cucumber_genomic
Source Sequence ggccgcgaattcactagtgattgtttagccttgtagcaga agcttctactaaatttgtggctccaaaacagcttatttgT CTCTCtgaaagggttatgagtacgtgaaatctgctaaagt atccgttttaattaaactaatcttttcttaatttttaaat tttattttggcttttgtttctttgagtttatttTCTCTCT CTCTCTCTCTCtaaaatgatctctttgTCTCTCtagcttt atgtttacatacgtgtgatcaacgattgatccatcaccat caattaattgaactctttttttccttttcccaTCTCTCTC TCTCTCTCTCTCTCTCTCttttaataattaatcATTATTA TTcatcttgattaattaattaactaaacaaaattcattag aaggtctaaattaactaaacccaatgtggaaggaagttgc aattacattgcatgttttcctttccttttcccttcattaa atagtgacctcttttcaatttcaatttccatgcatgtggt caagtcttctaattatctatccttctcatccaaattattt gggttttcctttcatgtttcattgaatcttcattttctca attgggagatatgatttgttgaattaaACACACtgaatat gtgaattgatattgtttgttttattattttctacccaaat atccataaccgaattgcttctgctacaaggctaaac
Developer NIVTS
Document Fukino et al. 2008

motif (tc)13ttttaataattaatc(att)3
PCR product (bp) 271
fwd primer CSN051-F
fwd primer seq. atcaacgattgatccatcaccatc
rev primer CSN051-R
rev primer seq. aagacttgaccacatgcatggaaa
fwd primer_for postlabel CSN051-FA
fwd primer seq._for postlabel attatcaacgattgatccatcaccatc
rev primer_for post label CSN051-RA
rev primer seq._for post label tttaagacttgaccacatgcatggaaa

Line allele-1 allele-2
AR_5 250 250
Harukei3 250 250
Nou4 250 250
PI 263 263
Santou 273 273
hardwickii 263 263

Population Linkage Group Position
CSRILs 6 68.7

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain